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            2019-09-17瀏覽量:1065

            在線數據可視化系列一:維恩圖

            維恩圖

             

            維恩圖(Venn),也叫溫氏圖、韋恩圖、范氏圖,用于顯示元素集合重疊區域的圖表。韋恩圖是關系型圖表,通過圖形與圖形之間的層疊關系,來表示集合與集合之間的相交關系。

            在微生物的研究中,可根據每個樣品的OTU/gene/species在每個樣品的豐度,計算出每個樣品或組間共有和特有的OTU/gene/species,然后繪制維恩圖展示。

             

            在之前的《幾種維恩圖的繪制方法》已經為大家分享過以下幾種方式繪制維恩圖:

            1. 在線網址http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

            2. VennPainter軟件

            3. R包VennDiagram

            其中,在線繪制的方法非常簡單、方便。這一期,我們總結總結都有哪些在線網站可以繪制,又各自有什么特點。

             

            一  在線繪制VENN-1

            ? 推薦指數:★

            ? 網址:

            http://www.biovenn.nl/index.php

            ? 特點:

                ? 2~3元

                ? 文件上傳、在線填寫

                ? 豐富的參數設置

                ? 另存為svg、png格式結果

            二  在線繪制VENN-2

            ? 推薦指數:★

            ? 網址:

            http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn4.cgi

            ? 特點:

                ? 2~4元

                ? 在線填寫集合內容

                ? 另存為gif格式結果

            三  在線繪制VENN-3 

            ? 推薦指數:★★

            ? 網址:

            https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

            ? 特點:

                ? 2~4元

                ? 在線填寫集合內容

                ? 可簡單設置顏色、線條、字體

                ? 另存為png格式結果

            四  在線繪制VENN-4

             ? 推薦指數:★★★

            ? 網址:

            http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

            ? 特點:

                ? 2~5元

                ? 文件上傳、在線填寫

                ? 豐富的統計信息

                ? 下載svg、png格式結果

            五  在線繪制VENN-5 

            ? 推薦指數:★★★★

            ? 網址:

            http://www.interactivenn.net/

            ? 特點:

                ? 2~6元

                ? 文件上傳、在線填寫

                ? 可設置顏色、字體大小、圖片透明度

                ? 下載svg、png格式結果

            六  在線繪制VENN-6

             ? 推薦指數:★★★★★

            ? 網址:

            http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html

            ? 特點:

                ? 2~6元

                ? 文件上傳、在線填寫

                ? 豐富的參數設置

                ? 下載svg、png格式結果

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